В известном токийском районе Акихабара, проживает парень, являющийся сторонником заговоров, а также любителем научной деятельности. Не так давно, Окабе Ринтаро, открыл собственную "Лабораторию проблем времени". Сотрудничать и помогать своеобразному студенту, стали совершенно разные по характеру личности. Несмотря на разносторонность, молодые ребята смогли найти общей язык и интерес, благодаря чему, их немногочисленные, странноватые эксперименты, начали приносить плоды.
Вследствие совместной деятельности, парни и девушки, во главе Ринтаро, создали машину времени из микроволновой печи и разнообразного барахла, с местной распродажи. Испытания аппарата, не заставило долго ждать юных учёных. Таким образом, коллектив находит способ перемещать сознания, во временном пространстве. Данное открытия, образовывает множество глобальных, неразрешимых проблем. Попав в, так называемые "Врата Штейна", Окабе требуется найти способ вернуть всё на прежние места, а также спасти друзей.