По причине ужасной катастрофы, многие обитатели Земли погибли. Выжившие, долгое время пытались восстановить прежнее существование, однако нападение неизвестных существ, заставило в очередной раз людей, окунуться в ужас. Чтобы противостоять огромным монстрам, была создана военная организация, по созданию гигантских роботов, управлять которыми могут, только достойные подростки. Одним из таких, оказался четырнадцатилетний Синдзи Икари, являющимся сыном директора секретной базы.
По наставлению отца, юноша приступает к тренировкам, чтобы в ближайшем времени, вступить в схватку с атакующими врагами. Однако, миролюбивый старшеклассник, не желает вести военную деятельности, несмотря на сложившуюся ситуацию. На фоне этого, между близкими родственниками разгорается конфликт, вследствие которого, парень, не желая больше видеть родного человека, решает покинуть неблагополучное место. Однако, встреча с загадочной, скромной девушкой, заставляет повременить с действиями Синдзи.