Кайдзю – гигантские, сверхъестественные монстры, которые внезапно появились на территории Японии, угрожая безопасности всего населения. С каждым новым днем, число их жертв растет, города рушатся, а государство все больше напоминает разруху. Дабы противостоять новой угрозе, правительство создает специализированный отряд элитных солдат, которые вооружены по последнему слову техники. Таким образом, у человечества появился шанс изменить ситуацию в лучшую сторону, и подарить следующему поколению лучшую жизнь.
Многие молодые люди мечтают о том, чтобы быть зачисленными в их ряды, однако не каждому дано пройти сложный отбор. Тем более что кандидат должен соответствовать определенным требованиям. Одним из таких становится 32-летний Кафка Хибино, который уже несколько раз, пробовал пройти конкурс. Однако, не имея никаких выдающихся данных, навыков либо талантов, ему постоянно отказывают. Но в той ситуации, когда город усеян телами погибших существ, герою приходится устроиться в специальную клининговую компанию. А в один из дней, его скучное, однообразное существование меняется кардинальным образом, так как, неожиданно он сам становится кайдзю. Но хуже всего, что теперь на него самого открыта охота, и чтобы выжить, Кафка придется приложить максимум усилий.